En effet, dans la maison familiale, à Wehr, c’est tout d’abord la musique, en particulier le piano, qui lui procure beaucoup de plaisir. A l’âge de huit ans, avec sa sœur, la violoniste Anne-Sophie Mutter, il est lauréat du concours fédéral « Jugend musiziert » (Jeunesse musicienne). D’autres succès suivront, entre autre une distinction de premier lauréat du concours Jecklin pour jeunes pianistes à Zurich. Christoph Mutter reçoit une formation de pianiste de concert au conservatoire de Winthertur / Suisse, et il suit des cours particuliers chez Enrique Barenboim à Tel Aviv.